醫院污水含有病原體、重金屬、消毒劑、有機溶液、酸、堿以及放射性物質，醫院污水處理主要就是消毒，即殺滅病原體，常見的方法就是二氧化氯進行氯化消毒。如何選擇醫院污水消毒設備二氧化氯發生器就顯得很重要了。
1.原材料成本：
根據成本使用的不同，我們大致的將不同的消毒工藝進行了升序排列，他們一次是：液氯、次氯酸鈉發生器、二氧化氯發生器、紫外線、臭氧。
從中我們可以看出，最便宜的消毒殺菌工藝是采用液氯，第二是并列的次氯酸鈉發生器和二氧化氯發生器，最后的兩個是紫外線和臭氧。其中雖然液氯的使用成本比較低，但是我們不能忽略一個問題，那就是液氯是一種危險的化學品，不容易儲存，在使用時要冒著泄露、爆炸等風險，所以我們并不推薦使用。
而第二的次氯酸鈉發生器和二氧化氯發生器是我們所推薦的，因此這兩個設備的使用成本基本相同，但是氯酸鈉發生器使用電解食鹽水工藝，原材料是食鹽，因此比二氧化氯發生器的原材料比較好購買，而且價格也便宜，唯獨需要一定的電力。而最后兩種紫外線和臭氧，這兩種設備的成本投入很高，一般醫院無法承受，所以可以不用考慮。

2.殺菌效果：
在殺菌消毒效果對比中殺菌效果分別為：臭氧，次氯酸鈉發生器，二氧化氯發生器，液氯，紫外線。其中臭氧的殺菌效果最好，次氯酸鈉發生器和二氧化氯發生器次之，最后是液氯和紫外線。臭氧的殺菌消毒效果最好，但是在使用成本的制約下臭氧殺菌的性價比不高因此不推薦使用。
第二個和第三個的次氯酸鈉發生器和二氧化氯發生器的殺菌消毒效果顯著，而且使用成本也不是很高，因此我們推薦大家使用次氯酸鈉發生器和二氧化氯發生器。液氯殺菌目前正在逐步被淘汰，而紫外線的瞬間殺毒好，但不能保證二次復發，因此不做推薦。
綜合使用成本和殺菌消毒的效果來看，最好的殺菌消毒效果是使用次氯酸鈉發生器和二氧化氯發生器，這兩種設備的殺菌消毒效果可靠，而且使用成本很低，非常適合預算緊張以及需要大批量處理污水的醫院衛生所使用。

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